生物医学网络科学Biomedical Network Science

BioGRID

人工整理的蛋白、遗传与化学相互作用数据库。

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领域:分子网络与基因调控 相关专题:生物分子网络与拓扑特征

适合的研究问题

获得实验支持的物理或遗传互作网络,研究度分布、枢纽基因与致死性的关系,或作为 PPI 的高可信来源。

数据类型

多物种的蛋白–蛋白、遗传相互作用,另含化学–蛋白关联与翻译后修饰数据。

获取方式

网页检索;下载页提供 TAB、PSI-MI 等格式全库文件;提供 REST API。

访问限制与许可

数据免费提供;数据许可的具体条款以官方说明为准。

相关工具与格式

Cytoscape、igraph、NetworkX

引用要求

Oughtred R, et al. The BioGRID database: a comprehensive biomedical resource of curated protein, genetic, and chemical interactions. Protein Sci 2021. DOI: 10.1002/pro.3978。