复杂网络中的同步
Synchronization in complex networks
Arenas A, Díaz-Guilera A, Kurths J, Moreno Y, Zhou C
系统综述网络拓扑如何影响同步：Kuramoto 模型的同步起点与路径、主稳定函数与可同步性及应用。
Brain Networks & Connectomics
脑网络与连接组
从 MRI、fMRI、dMRI 与电生理数据出发，介绍脑图谱、连接估计、脑网络拓扑、动态功能连接、多层网络与脑网络控制。
Topics专题
脑连接组：结构与功能连接
The connectome: structural and functional connectivity
从 dMRI 与 fMRI 构建结构、功能与有效连接网络，解读模块、枢纽、梯度与布线代价，并检验组间与个体差异。
动态功能连接与多层脑网络
Dynamic and multilayer brain networks
研究脑功能连接如何随时间变化、如何检验其统计显著性，以及如何把结构、功能与电生理网络放在同一框架中分析。
Interactive交互可视化
Code代码示例
Papers论文精读
绘制人类大脑皮层的结构核心
Mapping the structural core of human cerebral cortex
Hagmann P, Cammoun L, Gigandet X, Meuli R, Honey CJ, Wedeen VJ, et al.
用弥散谱成像构建全皮层高分辨率结构网络，发现位于后内侧与顶叶皮层的结构核心，并显示结构连接强度能预测静息态功能连接。
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复杂脑网络：结构与功能系统的图论分析
Complex brain networks: graph theoretical analysis of structural and functional systems
Bullmore E, Sporns O
系统梳理用图论分析脑结构与功能网络的流程与发现，总结小世界、枢纽、模块化等跨尺度、跨模态反复出现的特征。
脑连接的复杂网络指标：用法与解读
Complex network measures of brain connectivity: uses and interpretations
Rubinov M, Sporns O
按神经科学含义整理脑网络常用图论指标及其解读，并发布 Brain Connectivity Toolbox。
人类连接组的富人俱乐部组织
Rich-club organization of the human connectome
van den Heuvel MP, Sporns O
在 21 人结构网络中发现 12 个双侧枢纽互连远超随机预期，构成承担全局通信的富人俱乐部。
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动态功能连接：希望、问题与解释
Dynamic functional connectivity: promise, issues, and interpretations
Hutchison RM, Womelsdorf T, Allen EA, Bandettini PA, Calhoun VD, Corbetta M, et al.
综述动态功能连接的证据与方法，系统指出窗口、噪声、统计检验和神经解释上的问题。
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结构脑网络的可控性
Controllability of structural brain networks
Gu S, Pasqualetti F, Cieslak M, Telesford QK, Yu AB, Kahn AE, et al.
把线性控制理论用于人脑结构网络，提出平均、模态、边界三种区域可控性及其系统分布。
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网络控制原理预测秀丽隐杆线虫连接组中的神经元功能
Network control principles predict neuron function in the Caenorhabditis elegans connectome
Yan G, Vértes PE, Towlson EK, Chew YL, Walker DS, Schafer WR, et al.
用目标可控性分析线虫连接组，预测运动控制所需的神经元，并以单神经元消融实验验证 PDB 与 DD04/DD05。
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共同接收者中的突触组织预测输入神经元之间的连接
Synaptic organization in shared receivers predicts connectivity between input neurons
Zhang X
在两个成年果蝇连接组中，相连输入源的突触在共同接收神经元上靠得更近，这种空间信息可帮助预测未见过的输入神经元之间的连接。
Data & tools数据与软件
数据库OpenNeuro按 BIDS 标准组织的开放神经影像数据共享平台。数据集Human Connectome Project（HCP）健康成人高质量多模态 MRI 与行为数据，连接组研究的基准数据。数据库UK Biobank英国大型前瞻性人群队列，含遗传、健康记录与多模态脑影像。数据集ABIDE（自闭症脑影像数据交换）多中心自闭症谱系障碍与对照的静息态 fMRI 及结构像数据。软件/工具包ENIGMA Toolbox提供 ENIGMA 疾病效应量、HCP 组平均连接组与可视化的工具箱。软件/工具包Brain Connectivity Toolbox（MATLAB）脑网络图论指标的标准 MATLAB 函数集。软件/工具包bctpy（Brain Connectivity Toolbox for Python）Brain Connectivity Toolbox 的 Python 移植版。软件/工具包Nilearn用于神经影像统计分析与机器学习的 Python 库。软件/工具包GRETNA基于 MATLAB 的图形界面脑网络构建与图论分析工具箱。软件/工具包BrainNet Viewer绘制脑网络节点、边与皮层表面的 MATLAB 可视化工具。脑图谱Schaefer 2018 皮层分区基于静息态功能连接的多分辨率大脑皮层分区。脑图谱AAL / AAL2 / AAL3 图谱基于 MNI 单被试结构像的自动解剖标记分区。脑图谱Brainnetome Atlas（脑网络组图谱）基于连接模式划分的人脑图谱，含皮层与皮层下 246 个亚区。软件/工具包neuromaps收集、转换并比较脑图谱的 Python 工具箱，含空间置换零模型。数据集FlyWire成年雌性果蝇全脑电镜连接组。数据集Janelia MaleCNS雄性果蝇完整中枢神经系统（脑与腹神经索）电镜连接组。交互网站FlyScope果蝇等连接组在线浏览器，关注共享输入在树突上的位置。软件/工具包OpenWorm以秀丽隐杆线虫为对象的开放科学数字生物体建模项目。数据集WormWiring线虫神经连接组数据与可视化网站。