生物医学网络科学Biomedical Network Science

OpenWorm

以秀丽隐杆线虫为对象的开放科学数字生物体建模项目。

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领域:脑网络与连接组 · 网络动力学与控制 相关专题:脑连接组:结构与功能连接、同步与协同动力学、网络可控性与稳定性

适合的研究问题

把连接组与神经元、肌肉、身体力学模型结合,研究网络结构如何产生行为与动力学。

数据类型

包含 Sibernetic 身体模拟器、NeuroML 格式的线虫连接组、Geppetto 可视化平台等子项目。

获取方式

代码托管于 GitHub(https://github.com/openworm )。

访问限制与许可

代码、数据与模型采用 MIT 许可。

相关工具与格式

NeuroML、Sibernetic、Geppetto、c302

引用要求

官网未指定引用;项目概述论文:Szigeti B, et al. OpenWorm: an open-science approach to modeling Caenorhabditis elegans. Front Comput Neurosci 2014. DOI: 10.3389/fncom.2014.00137。