生物医学网络科学Biomedical Network Science

ENIGMA Toolbox

提供 ENIGMA 疾病效应量、HCP 组平均连接组与可视化的工具箱。

访问官方网站 ↗

领域:脑网络与连接组 相关专题:脑连接组:结构与功能连接、网络分析流程与 NetworkX 实践

适合的研究问题

把多中心脑形态学结果放到连接组背景下解释,例如检验疾病相关萎缩是否沿结构或功能连接分布、是否集中在枢纽区。

数据类型

内置 ENIGMA 联盟多种疾病的汇总统计、HCP 健康成人组平均功能与结构连接矩阵(多种分区),以及基因表达等脑图谱数据。

获取方式

Python 与 MATLAB 版本;Python 版按文档从 GitHub 克隆后用 pip 安装;load_fc()、load_sc() 读取连接矩阵。

访问限制与许可

代码为 BSD-3-Clause 许可;所含 HCP 等数据另受原数据条款约束。

相关工具与格式

Python、MATLAB、BCT、表面可视化(Desikan-Killiany、Glasser、Schaefer 分区)

引用要求

Larivière S, et al. The ENIGMA Toolbox: multiscale neural contextualization of multisite neuroimaging datasets. Nat Methods 2021. DOI: 10.1038/s41592-021-01186-4。