生物医学网络科学Biomedical Network Science

ChEMBL

EMBL-EBI 人工整理的类药小分子生物活性数据库。

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领域:网络医学与药物网络 相关专题:疾病模块、网络邻近度与药物重定位

适合的研究问题

获取化合物–靶点活性数据,构建药物–靶点二分网络,或为网络药理学预测提供实验活性证据。

数据类型

从文献与数据库整理的化合物、靶点和生物活性测定数据,每个版本有独立 DOI。

获取方式

网页检索;数据库转储下载(多种格式);REST API;Python 客户端 chembl_webresource_client。

访问限制与许可

CC BY-SA 3.0。

相关工具与格式

chembl_webresource_client、RDKit、Cytoscape

引用要求

Zdrazil B, et al. The ChEMBL Database in 2023. Nucleic Acids Res 2024. DOI: 10.1093/nar/gkad1004;并注明所用版本。