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CMap / LINCS L1000

大规模药物与基因扰动后细胞转录谱资源。

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领域:网络医学与药物网络 · 分子网络与基因调控 相关专题:疾病模块、网络邻近度与药物重定位

适合的研究问题

以疾病表达特征反向匹配扰动特征,寻找可能逆转疾病状态的化合物;把扰动特征映射到分子网络上分析作用机制。

数据类型

L1000 平台测得的大量化合物、基因敲低/过表达扰动谱(GCTx 格式,文件很大)。

获取方式

NIH LINCS 项目网站汇总数据与工具;L1000 数据可从 GEO(如 GSE92742)下载。

访问限制与许可

clue.io 页面公告已于 2026-01-31 退役,公开数据转由 GEO 提供;原 clue.io 数据和工具限学术非营利机构使用。以官方说明为准。

相关工具与格式

cmapPy、GCTx、GEO

引用要求

Subramanian A, et al. A next generation Connectivity Map: L1000 platform and the first 1,000,000 profiles. Cell 2017. DOI: 10.1016/j.cell.2017.10.049。