| 适合的研究问题 | 从 bulk 或单细胞表达数据推断转录因子活性；作为调控网络先验知识，与数据驱动的推断网络比较。 |
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| 数据类型 | CollecTRI 汇总多种资源得到带激活/抑制符号的 TF–靶基因关系；DoRothEA 为较早版本，按证据给出 A–E 置信等级。覆盖人和小鼠。 |
| 获取方式 | 通过 decoupler（Python：pip install decoupler；R：Bioconductor decoupleR）或 OmnipathR 获取；DoRothEA 另有 Bioconductor 包 dorothea。 |
| 访问限制与许可 | CollecTRI 与 dorothea 仓库为 GPL-3.0；所整合的上游资源各有许可。 |
| 相关工具与格式 | decoupler/decoupleR、OmniPath、Scanpy |
| 引用要求 | CollecTRI：Müller-Dott S, et al. Nucleic Acids Res 2023. DOI: 10.1093/nar/gkad841；DoRothEA：Garcia-Alonso L, et al. Genome Res 2019. DOI: 10.1101/gr.240663.118。 |