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DISGENET

整合基因–疾病与变异–疾病关联的知识平台。

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领域:网络医学与药物网络 相关专题:疾病模块、网络邻近度与药物重定位

适合的研究问题

获取疾病相关基因集合,作为疾病模块分析的种子基因;比较疾病之间共享基因与网络分离度。

数据类型

基因–疾病与变异–疾病关联,附证据评分;免费学术方案只含专家整理部分(官网写明 14k+ 基因、18K+ 疾病)。

获取方式

网页平台;REST API;R 包;Cytoscape App(视许可方案而定)。

访问限制与许可

免费学术方案须申请,仅含专家整理数据;完整数据与更多 API 功能为付费方案。以官网说明为准。

相关工具与格式

disgenet2r、Cytoscape、NetMedPy

引用要求

Piñero J, et al. The DisGeNET knowledge platform for disease genomics: 2019 update. Nucleic Acids Res 2020. DOI: 10.1093/nar/gkz1021(以官网最新引用要求为准)。