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HuRI(人类参考蛋白互作组)

系统酵母双杂交筛选得到的人类二元蛋白互作图谱。

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领域:分子网络与基因调控 · 网络医学与药物网络 相关专题:生物分子网络与拓扑特征、疾病模块、网络邻近度与药物重定位

适合的研究问题

在较少受研究偏倚影响的系统筛选网络上分析枢纽、模块与疾病基因位置,并与文献整理网络对比。

数据类型

HuRI(HI-III-19)约 53,000 对 PPI,筛选约 17,500 个基因;另提供 HI-II-14、HI-I-05、HI-union 与文献二元互作集 Lit-BM。

获取方式

门户下载页提供 TSV(Ensembl 基因 ID)与 PSI-MI 格式文件。

访问限制与许可

官网未写明数据许可,以官方说明为准。

相关工具与格式

PSI-MI、Cytoscape、igraph、NetworkX

引用要求

Luck K, et al. A reference map of the human binary protein interactome. Nature 2020. DOI: 10.1038/s41586-020-2188-x。