| 适合的研究问题 | 对基因集合做代谢与信号通路富集;把网络模块映射到 KEGG 通路图上解释功能。 |
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| 数据类型 | 人工绘制的通路图(KEGG PATHWAY)、KO 直系同源系统、基因组、化合物、药物与疾病等数据库。 |
| 获取方式 | 网页浏览;KEGG REST API;FTP 批量下载需订阅。 |
| 访问限制与许可 | 学术用户可免费使用网站;FTP 批量数据须订阅,用于提供服务的学术用户需取得服务提供者许可;非学术用户须获得商业许可。官方声明 KEGG 不是公共数据库,详见 https://www.kegg.jp/kegg/legal.html 。 |
| 相关工具与格式 | clusterProfiler、KEGGREST、Pathview |
| 引用要求 | Kanehisa M, et al. KEGG for characterizing genomes and pathways in the biosphere. Nucleic Acids Res 55 (2027). DOI: 10.1093/nar/gkag1042;Kanehisa M, Goto S. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Nucleic Acids Res 2000. DOI: 10.1093/nar/28.1.27(官网列出的其他引用见 kegg1.html)。 |