| 适合的研究问题 | 检验网络模块或排序基因列表是否富集于标志性通路、转录因子靶点或扰动特征基因集。 |
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| 数据类型 | 分为 Hallmark、通路、调控靶点、免疫特征等多个集合,分人类与小鼠两个版本。 |
| 获取方式 | 免费注册(邮箱登录)后下载 GMT 等格式;R 包 msigdbr 也可获取。 |
| 访问限制与许可 | v6.0–v7.5.1 与 v2022.1 及以上版本采用 Creative Commons 风格许可,部分基因集有附加条款(详见官网许可页);v5.2 及更早版本为单用户内部研究许可。 |
| 相关工具与格式 | GSEA、fgsea、clusterProfiler、msigdbr |
| 引用要求 | Subramanian A, et al. Gene set enrichment analysis. PNAS 2005. DOI: 10.1073/pnas.0506580102;并视情况引用 Liberzon A, et al. Bioinformatics 2011. DOI: 10.1093/bioinformatics/btr260 和 Liberzon A, et al. Cell Syst 2015. DOI: 10.1016/j.cels.2015.12.004;以及基因集的原始来源。 |