| 适合的研究问题 | 查找疾病与对照的表达谱，用于 WGCNA 共表达网络、调控网络推断或差异网络分析。 |
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| 数据类型 | 数十万个系列（Series）和数百万个样本，涵盖芯片与测序数据；每个数据集的规模与平台见各自页面。 |
| 获取方式 | 网页检索与下载；FTP；GEOquery（R）、GEOparse（Python）；GEO2R 在线分析。 |
| 访问限制与许可 | 公开数据无访问限制；使用时须引用原始数据集与相关论文。 |
| 相关工具与格式 | GEOquery、limma、WGCNA、DESeq2 |
| 引用要求 | Barrett T, et al. NCBI GEO: archive for functional genomics data sets—update. Nucleic Acids Res 2013. DOI: 10.1093/nar/gks1193；并引用所用数据集（GSE 编号）的原始论文。 |