| 适合的研究问题 | 在单细胞数据中识别转录因子调控子，结合基序富集过滤间接靶点，并按调控子活性对细胞聚类。 |
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| 数据类型 | R（SCENIC）与 Python（pySCENIC）实现；需下载 cisTarget 基序排序数据库（体积较大）。 |
| 获取方式 | pip install pyscenic；文档：https://pyscenic.readthedocs.io/ ；另有 Nextflow 流程与 Docker 镜像。 |
| 访问限制与许可 | pySCENIC 为 GPL-3.0；cisTarget 数据库的使用条款以官方说明为准。 |
| 相关工具与格式 | arboreto（GRNBoost2）、Scanpy、loom 格式、SCope |
| 引用要求 | Aibar S, et al. SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nat Methods 2017. DOI: 10.1038/nmeth.4463；Van de Sande B, et al. Nat Protoc 2020. DOI: 10.1038/s41596-020-0336-2。 |