TCGA / NCI Genomic Data Commons（GDC）
NCI 的癌症基因组数据共享平台，收录 TCGA 等项目数据。
领域：分子网络与基因调控 · 网络医学与药物网络 相关专题：基因调控网络推断与共表达分析、疾病模块、网络邻近度与药物重定位
| 适合的研究问题 | 构建癌症类型特异的共表达或调控网络；把突变、表达与临床结局放在网络中联合分析。 |
|---|---|
| 数据类型 | TCGA 等多个癌症基因组项目的测序、表达、拷贝数、甲基化、临床与生物样本数据。 |
| 获取方式 | GDC Data Portal 网页下载；GDC Data Transfer Tool 批量下载；GDC API；R 包 TCGAbiolinks。 |
| 访问限制与许可 | 高层级、不可识别个人的数据为开放访问；低层级测序、胚系变异等为受控访问，须经 dbGaP 授权与 eRA Commons 认证。 |
| 相关工具与格式 | GDC Data Portal、gdc-client、TCGAbiolinks |
| 引用要求 | Grossman RL, et al. Toward a shared vision for cancer genomic data. N Engl J Med 2016. DOI: 10.1056/NEJMp1607591；并按 GDC 指南引用具体项目。 |