小世界与无标度网络模型07 / 17
测量优先连接与非线性优先连接
BA 模型把优先连接写成一个假设。它在真实网络中是否成立、函数形式是不是线性,可以用网络的时间序列数据直接检验。
从两个时间快照测量
如果优先连接成立,节点在一小段时间内获得的新边数应当与它当前的度成正比:。Jeong、Néda 与 Barabási(2003)提出的做法是:
- 取网络在 与 两个时刻的快照( 相对网络规模很短);
- 对 时度为 的所有节点,统计它们在 内获得的新边数,平均后得到 的估计;
- 由于单个度类的样本很少、噪声大,改看累积函数 若 ,则 :无优先连接()时斜率为 1,线性优先连接时斜率为 2。
用这种方法,引文、互联网等网络得到的 接近 1;科研合作网络与演员合作网络则是亚线性的()。本专题代码示例在模拟网络上演示了这一测量。
蛋白质相互作用网络中的优先连接:Eisenberg 与 Levanon(2003, Phys. Rev. Lett.)没有时间快照,于是借助跨物种比较给酵母蛋白质估计“演化年龄”(同源基因在多远的物种中仍能找到)。他们发现:越古老的蛋白,在当前相互作用网络中的连接越多;蛋白在演化中获得的相互作用数与其连接度成正比。这是用比较基因组学替代时间序列、在生物网络中检验优先连接的早期范例。注意年龄估计本身依赖序列检测灵敏度,古老且研究充分的蛋白也更可能测到更多相互作用,这两个偏倚会同方向地放大结果。
非线性优先连接
设 。Krapivsky、Redner 与 Leyvraz(2000)的分析表明,只有 才给出纯幂律:
- 亚线性():富者愈富被削弱,度分布变为拉伸指数型 ;最大度只按 增长,枢纽受到明显限制。
- 线性():BA 模型,,。
- 超线性():富者愈富被放大,出现“赢家通吃”:少数(极端情况下一个)节点获得几乎所有新连接,最大度按 线性增长,网络呈“中心–辐条”(hub-and-spoke)结构; 时这种凝聚从一开始就发生。
所以观察到的度分布偏离纯幂律,可能只是优先连接略偏非线性的结果——例如亚线性的合作网络更适合用拉伸指数描述。
测量 需要节点“出生”与连边的时间信息。只有单一快照时,常见的替代做法(用年龄代理时间、用横断面的度–年龄关系反推)都会混入适应度差异与观测偏倚:一个节点度高,可能因为它早到、可能因为它“更有吸引力”,也可能只是被研究得更多。用快照数据声称“证明了优先连接”需要非常谨慎。