度相关性与网络结构的高阶统计09 / 13
k-核分解
定义
-核(-core; Seidman, 1983, Social Networks):反复删除度小于 的节点后剩下的最大子图;其中每个节点在子图内的度都至少为 。
核数(coreness,core number):节点 所属的最大 -核的 。核数为 的节点构成 -壳(-shell)。
-核分解:依次求出所有 -核,得到一组嵌套的子图 。
剥离算法
从
开始,反复删去当前度小于
的节点(删除会降低邻居的度,可能引发连锁删除),直到没有可删的节点,剩下的就是
-核;然后
。Batagelj
与 Zaversnik(2011, Advances in Data Analysis and
Classification)用“按当前度分桶”的方法使整个分解的时间复杂度为
。伪代码见数学推导与算法,代码示例用最小堆实现,复杂度
,并与
nx.core_number 逐节点对照。
算例:一个三角形 加上一条挂在 上的路径 。删去度为 1 的 , 的度降为 1,也被删去;剩下三角形中每个节点度为 2,于是 的核数为 2, 的核数为 1。注意 的度为 3,但核数只有 2:核数衡量的是“嵌在多稠密的子图里”,而不是边数。
核数、度与度相关
核数与度高度相关但不等同。度相同的节点可以处在不同的壳层(代码示例中,幂律随机网络里度为 6 的节点分布在 2、3、4 三个壳层);一个连着很多叶子的枢纽可能核数很低。度相关直接影响核结构:同配网络中高度节点彼此相连,形成深而稠密的内核;异配网络的内核浅。代码示例中,同一度序列的网络经同配重连后,最大核数从 9 升到 20。还要注意,BA 网络中每个新节点恰好带 条边加入,整张图就是一个 -核,壳层结构是平凡的,不适合作为 k-核分析的模型示例。
应用
- 影响力传播者:Kitsak 等(2010, Nature Physics)在多个真实网络的 SIR/SIS 模拟中发现,单个起始节点的传播范围由其核数比由度或介数中心性预测得更好(精读见 Kitsak 2010,与网络上的传播与免疫相联系)。
- 相互作用组的“骨架”:Wuchty 与 Almaas(2005, Proteomics)对酵母蛋白质相互作用网络做核分解,发现越靠内层的核中,必需蛋白和进化保守蛋白的比例越高,而且这一结果对相互作用数据的误差较稳健。
- 脑结构核心:Hagmann 等(2008, PLoS Biology)用 -核与强度版本的 -核分解弥散谱成像结构网络,识别出位于后内侧与顶叶皮层的结构核心(精读见 Hagmann 2008)。
- 理论:Dorogovtsev、Goltsev 与 Mendes(2006, PRL)研究了随机网络中 -核的出现条件(-核渗流),对 它与普通巨分支出现的连续相变性质不同。